Cílem činnosti SBP je podpora preklinického a klinického výzkumu v biologické psychiatrii a šíření současných poznatků z biologické psychiatrie mezi klinickou a laickou veřejností.

SBP pořádá vědecká setkání, semináře a zasedání expertních skupin za účasti pracovníků v oboru biologické psychiatrie a příbuzných vědeckých oborů.

SBP podporuje popularizaci vědeckých poznatků biologické psychiatrie a vyjadřuje se veřejně k problémům v oblasti biologické psychiatrie a souvisejících oblastí.

SBP koordinuje svoji činnost s mezinárodními organizacemi podobného zaměření, zejména se Světovou federecí společností pro biologickou psychiatrii (WFSBP).